University of Washington の浜崎伸彦さん(@Nobu_Hamazaki)がゲスト。Human RA-Gastruloid論文、条件探索のコツ、ステージング問題、卵子形成論文、PI生活、今後目指す合成的発生生物学の方向性など (12/12収録)

Show Notes (番組HP):

浜崎ラボHP
博士課程(の後半)での所属ラボ：中島欽一ラボ
日本での所属ラボ：林克彦ラボ (現在は阪大)
日本にいたときの卵子形成転写因子論文
かぐや論文
Parthenogenesisのレビュー
留学先の所属ラボ：Jay Shendureラボ
留学先でのHuman RA-Gastruloid論文
最初にあったマウスGastruloid論文
Matrigel
おすすめの発生生物学の教科書ギルバート発生生物学、ウォルパート発生生物学とラングマン人体発生学とそのムービー
JayのGestalt
イベントのレコーディング
シュペーマンのオーガナイザー (pdf)
Turner Syndrome
Wntアゴニストのカイロン
下流のBrachyury (T)という転写因子
最近出ていた脊索が現れる3D trunk organoid論文
bioRxivに最初に出た論文
とその数日後にアップロードされた競合論文その１２３４
の出版論文としての結果 1 2 3 4
最近溜まっているEmbryonic single cell data 1 2 3 4 5 6 7
10x
sci-RNA-seq3
Smart-seq3
Wei Yangさん（Jayラボメンバーページ）
マーカージーンをGPTに入れると予測してくる
Mappingする方法
UMAPのco-embedding
Foundation modelを作っていく例
今村さん
とやっていたgene regulation
Zygotic genome activation
精子のヒストンがプロタミンに置き換わる機構
残ったヒストンがinter-generationalなepigenetic memoryに関与する？（pdf）
父が肥満だと子が肥満になりやすい、母だとそうでもない
ダーウィン vs ルイセンコ
iPSで精子作成している例
減数分裂？に関するプレプリントパキテンで止まっている
山中論文は24から4へ
卵子が大きくなるためにはアクアポリンが必要。<- Glycineチャネルを介した浸透圧による水分流入のことでした。
卵子形成に伴ってゲノムが徐々に無秩序にする 1 2
卵子のヒストンはモノユビキチン化が盛ん 1 2
不妊治療でホルモン注射や針を刺す場合
Polony Sequencing
最近宇宙とか言ってる
I-5: 東海岸を縦に貫く道路
At the Helm: Leading Your Laboratory
Westlake University
前回の政権でのES細胞についてのポリシー：...

#84 Synthetic developmental biology

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