Klecknerラボ、この秋からUMass アマーストで独立予定、Researchat.fmのTadasu Nozaki (@tadasu443)さんがゲスト。大学の近況、ジョブハント経験談、独立後の研究の方向性、染色体ペアリング馴れ初め、授業計画、遺伝研での生活について (5/25 収録)

Show Notes (番組HP):

Researchat.fm
Klecknerラボ … Nancy Klecknerは本当に偉大な研究者だと思う。一緒に仕事できてよかった (tds)。
博士の時の代表的な仕事 1 2 …前島先生、そしてたくさんの方にお世話になりました(tds)
ポスドクの仕事：Rapid homologue juxtaposition
tadasuの留学紀
五十嵐さん回 1 2 3 4
の就活ノート … 本当にすばらしく参考になりました。ありがとうございました。(tds)
安田さん回 … 背中をおしていただいた回。Ryoheiさんの「アメリカで研究続けるの？」というストレートな問いに、NRの二人がもにょっているのがいい (tds)
Jeff Lichtman … 名前ど忘れ&読み方分からなかった... (tds)
NeuroRadio聴いたほうが良いっすよ … 本当にNRの人気が高い (tds)

永島さんラボ
Stadtman
UMass Department of Biology … tadasuの就職先
ハエはテストチューブ、山本さん回 1 2
キバハリアリは染色体が１本 … 遺伝研今井先生の研究
アリとかハチは半倍数性
シダの一種だと1000以上 … Ophioderma pendulum L (n= c. 630) Ninan 1958 Cytologia, 日本メンデル協会のキトロギアから出版されていた。
ウチダザリガニ300とか … 2n=376 by Niiyama
カモノハシはXY染色体はたくさん … X1,X2,X3,X4,X5, Y1,Y2,Y3,Y4,Y5
ホエザルの性染色体
クモの性染色体
Trillium (ブルワリー)
エンレイソウ
北大の校章
相同ペアリング中の染色体の絡まり
コムギは85%がリピート
染色体のばらつきと適応度 … 折角ふっていただいたのに、適当な議論だったかもしれないと反省。帰国後、やっと読むことができた鶴崎先生のご著書の中で、ザトウムシと染色体のばらつき、適応度、移動性に関する議論がしっかりされていた。もうちょっとよく考えたい。鶴崎先生のザトウムシ本、面白すぎるので皆様にぜひ読んでいただきたい (tds)
Hi-C
dCasでのラベリング
石黒さん
CloneSelect
齋藤さんNR出演回 1 2 3
前島ラボ … 前島先生には本当にお世話になりました。世界最高峰のクロマチン・染色体研究ラボの一つだと思いますのでご興味がある方はぜひ訪問してみてください(tds)。
30 nm ファイバーはアーティファクト、2008年論文、2012年論文1、2012年論文2
少数性生物学 … あまりにも最高すぎてよかった。未だに少数性について考えている。少数性reunionやってほしい。今ならいろいろ議論できることもありそう。(tds)
永井先生
ディクティの面白い生態 … このニュースレターのP.17で堀川先生が議論されている、細胞何個で子実体ができるのか問題。実はディクティは減数分裂に非常に重要なSpo11とRec8というタンパク質のホモログを持っておらず、その実態は謎に包まれている (tds)。
Denoisingの論文
平岡先生
Horsetail Movement論文
分裂酵母と出芽酵母の減数分裂方法の違い … 分裂酵母は染色体が少なくてみやすい。が、真核生物で広くみられるsynaptonemal complexがない（似たような構造はある)。そして、crossover interferenceも分裂酵母にはない。出芽酵母にはsynaptonemal complexとcrossover interferenceの両方がある。組換えの分子メカニズムは良く保存されている。
岡田先生
野地先生
少数性生物学トレーニングコース … 最高だった(tds)
Woods Hole MBLのトレーニングコース
AlphaFold3のコード公開に関するゴタゴタ
DDBJ
アメリカの気象情報が無くなる？
Cas9と配列は似てないが構造が似ているもののスクリーニング … LLMで生成してAlphafoldで予測、その中から良さげなものを人力でチェック！といいつつこれも一年前の論文なのでその後の動向をチェックする必要がある。50%ではなかったかも...
F...