University of South Carolinaで独立した小川優樹さん(@YukiOgawaPhD)ゲスト回。AISに興味を持つようになるまでの過程、ポスドクを行ったBaylor Collegeでの研究、ジョブハント体験記、最新作Hide-and-seekに関するディスカッション、今後の展望について (2/22 収録)

Show Notes (番組HP):

小川さんラボHP
岡野ジェイムス洋尚ラボ（再生医学研究室）
Matthew Rasband lab
星でやっていた薬物依存の研究
岡野ジェイムス洋尚先生
慶應の岡野栄之先生
パーキンソン病患者の脳内に胎児からの幹細胞を打って改善？
薬物依存における神経変性： 1 2
岡野ジェイムス洋尚先生が昔からやっていた研究の例
院でやっていたHuCの研究 (院での研究その1, KIFの内容は論文に出してました by 小)
Robert Darnell lab
HITS-CLIP
KIFレビュー
Ankyrin Gがなくなると軸索がなくなる (より正確には、「軸索が樹状突起っぽくなる」でした by 小)Neuronの突起はデフォルトが樹状突起になっているようで、軸索へのspecificationにAnkyrinGが関わっています by 小
小脳だとHuCが多いのtable2
胎児期と大人で変わってくる (院での研究その2)
軸索にはDNAがないミトコンドリアが集積する、のプレプリント
Axon carrying dendriteの報告論文とリップル参加率の違い
Paclitaxelを培養ニューロンに処理すると軸索が増える：1 2
以前に留学していた吉村武先生
International Society of Neurochemistry (日本神経化学会の国際学会)
の合宿、advanced school
神経化学会の雑誌で記事を書いています by 小
山本先生ラボ (その後ゲストとして登場して先に公開されてます)
MD Anderson Cancer Center
AISのタンパク質をBioID法で網羅的に解析した論文
BioID法、元論文
UCLAでの共同研究先：UCSFでした、間違えました(泣) by 小
Adelson Foundations
Mattラボで最初に出したRanbp2論文
抗体のクオリティ問題に関するエッセイ
AAV crude prepのAllenのプロトコルHide-and-Seek論文ではHEKを凍結融解しない方法を採用しています。細胞を壊さないためToxicな成分が少ないのかなと思ってはいますが比較したことはないです。 by 小
HiUGE法 (HDR非依存ノックイン)
Mattラボでのメインワーク日本語の記事
SLENDR (HDR依存ノックイン)
vSLENDR (HDR依存ノックイン)
HITI (HDR非依存ノックイン)
Split Cas9
smFP
スパゲッティ・モンスター教
宮脇敦史先生の蛍光タンパク質の本
TurboID
UltraID
日本で開発されたAirIDは直接相互作用しているタンパクの同定に適しているそうです
論文中で使った抗体依存的なビオチン化 1 2 3
同時期に出た、permeabilitzation後にラベルした論文 (共同研究その1)
Split TurboID
高野さん
高野さんの三者間シナプスでのSplit-TurboID
Subhojit Roy
共同研究その2
共同研究その3
五十嵐先生
井上さんご夫妻
Outlookでエキスポートする方法
Carolina Autism and Neurodevelopment (CAN) Research Center
University of South CarolinaのDepartment of Biological Sciences